ほか機体のベースカラーをお手軽に再現できるプリセットカラーが登場。ガンダム風のザク、百式風のガンダムなど簡単にカラーリングを変更できる。
また、過去作ではビルダーズパーツのみだったパーツのサイズ調整が、今作では武器を除く各パーツで可能に。パーツの大きさを自由に変えられるため、よりこだわったカスタマイズができるようになった。
『ガンダムブレイカー4』とは
また、カスタマイズしたガンプラで何度もミッションに挑めば新たなパーツも獲得。入手したパーツでガンプラを強化し、またミッションに挑むといったハクスラアクション要素も本シリーズの魅力となっている。